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Enregistrement W2021905136 · doi:10.4161/worm.25040

The role of the formin gene<i>fhod-1</i>in<i>C. elegans</i>embryonic morphogenesis

2013· article· yi· W2021905136 sur OpenAlexaff
Chrisotpher A Vanneste, David Pruyne, Paul E. Mains

Notice bibliographique

RevueWorm · 2013
Typearticle
Langueyi
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalAlberta Bible CollegeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésMicrofilamentCell biologyBiologyForminsActinMorphogenesisMyosinMicrotubuleCytoskeletonActin cytoskeletonGeneticsGeneCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the second half of embryogenesis, the ellipsoidal Caenorhabditis elegans embryo elongates into a long, thin worm. This elongation requires a highly organized cytoskeleton composed of actin microfilaments, microtubules and intermediate filaments throughout the epidermis of the embryo. This architecture allows the embryonic epidermal cells to undergo a smooth muscle-like actin/myosin-based contraction that is redundantly controlled by LET- 502/Rho kinase and MEL-11/myosin phosphatase in one pathway and FEM-2/PP2c phosphatase and PAK-1/p21-activated kinase in a parallel pathway(s). Although actin microfilaments surround the embryo, the force for contraction is generated mainly in the lateral (seam) epidermal cells whose actin microfilaments appear qualitatively different from those in their dorsal/ventral neighbors. We have identified FHOD-1, a formin family actin nucleator, which acts in the lateral epidermis. fhod-1 mutants show microfilament defects in the embryonic lateral epidermal cells and FHOD-1 protein is detected only in those cells. fhod-1 genetic interactions with let-502, mel-11, fem-2 and pak-1 indicate that fhod-1 preferentially regulates those microfilaments acting with let-502 and mel-11, and in parallel to fem-2 and pak-1. Thus, FHOD-1 may contribute to the qualitative differences in microfilaments found in the contractile lateral epidermal cells and their non-contractile dorsal and ventral neighbors. Different microfilament populations may be involved in the different contractile pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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