Impact of genetic variants on B-cell development and function in systemic lupus erythematosus
Notice bibliographique
Résumé
Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disorder characterized by the progressive loss of tolerance to nuclear antigens and the production of pathogenic autoantibodies. Genetic polymorphisms in genes involved in B-cell signaling, PTPN22, CSK, BLK and BANK1 , are associated with susceptibility to SLE. We have utilized a cohort of genotyped healthy subjects to better understand how these genetic variants contribute to the failure of B-cell tolerance seen in SLE. PBMC from these subjects are analyzed using multiparameter flow cytometry to assess the composition of the B-cell compartment and the response of B cells to stimulation via BCR and CD40. Our studies in healthy subjects who carry this variant have demonstrated alterations in the composition of the transitional and naïve B-cell pool. This is functionally correlated with the altered BCR response and enhanced survival of these cells in carriers of the risk variant. Three potentially functional BANK1 SNPs (including a splice branch point-site variant and two coding variants) are associated with SLE. We have shown that the BANK1 risk variants are associated with homeostatic changes in the peripheral B-cell pool that include a significant expansion of the total memory and preswitch memory compartment; and a significant decrease in naïve B cells in subjects homozygous for the BANK1 risk alleles. In further studies we have demonstrated that the BANK1 splice variant is associated with significantly reduced expression of the Δ2 isoform and that the risk haplotype is further associated with blunted proximal BCR signaling in naïve B cells and enhanced p-AKT in memory B cells. Studies are ongoing to investigate the impact of the BANK1 variant on plasma cell differentiation. Studies of healthy subjects who carry SLE risk genes demonstrate alterations in B-cell function and fate. These studies can then be extended to subjects with SLE to understand how these genetic variants impact B-cell development and tolerance in the setting of disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».