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Enregistrement W2022000951 · doi:10.1021/bi001128w

Mutational Analysis of Conserved Carboxylate Residues in the Nucleotide Binding Sites of P-Glycoprotein

2000· article· en· W2022000951 sur OpenAlexaff
Ina L. Urbatsch, Julien Michel, Isabelle Carrier, Marc-Étienne Rousseau, Romain Cayrol, Piet Gros

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantNucleotideBiochemistryVanadateATP hydrolysisPichia pastorisATPaseChemistrySite-directed mutagenesisYeastBiologyATP-binding cassette transporterMolecular biologyEnzymeTransporterRecombinant DNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutagenesis was used to investigate the functional role of six pairs of aspartate and glutamate residues (D450/D1093, E482/E1125, E552/E1197, D558/D1203, D592/D1237, and E604/E1249) that are highly conserved in the nucleotide binding sites of P-glycoprotein (Mdr3) and of other ABC transporters. Removal of the charge in E552Q/E1197Q and D558N/D1203N produced proteins with severely impaired biological activity when the proteins were analyzed in yeast cells for cellular resistance to FK506 and restoration of mating in a ste6Delta mutant. Mutations at other acidic residues had no apparent effect in the same assays. These four mutants were expressed in Pichia pastoris, purified to homogeneity, and biochemically characterized with respect to ATPase activity. Studies with purified proteins showed that mutants D558N and D1203N retained 14 and 30% of the drug-stimulated ATPase activity of wild-type (WT) Mdr3, respectively, and vanadate trapping of 8-azido[alpha-(32)P]nucleotide confirmed slower basal and drug-stimulated 8-azido-ATP hydrolysis compared to that for WT Mdr3. The E552Q and E1197Q mutants showed no drug-stimulated ATPase activity. Surprisingly, drugs did stimulate vanadate trapping of 8-azido[alpha-(32)P]nucleotide in E552Q and E1197Q at a level similar to that of WT Mdr3. This suggests that formation of the catalytic transition state can occur in these mutants, and that the bond between the beta- and gamma-phosphates is hydrolyzed. In addition, photolabeling by 8-azido[alpha-(32)P]nucleotide in the presence or absence of drug was also detected in the absence of vanadate in these mutants. These results suggest that steps after the transition state, possibly involved in release of MgADP, are severely impaired in these mutant enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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