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Enregistrement W2022000964 · doi:10.5483/bmbrep.2006.39.6.782

Characterization of Choristoneura fumiferana Genes of the Sixth Subunit of the Origin Recognition Complex: CfORC6

2006· article· en· W2022000964 sur OpenAlexafffund
Xaiochun Wang, Eric B. Carstens, Qili Feng

Notice bibliographique

RevueBMB Reports · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensCanadian Forest ServiceQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChoristoneura fumiferanaWestern blotSpruce budwormProtein subunitNorthern blotGeneBiologySouthern blotMolecular biologyGene expressionGeneticsBotanyPEST analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A new protein was cloned and identified as the sixth subunit of Choristoneura fumiferana origin recognition complex (CfORC6). The newly identified 43 kDa protein CfORC6 is much bigger than DmORC6 (25.7 kDa) and HsORC6 (28.1 kDa), though itos 23.85% identical to DmORC6 and 23.81% identical to HsORC6. Although the molecular weight of CfORC6 is close to ScORc6 (50 kDa), CfORC6 is only 14.03% identical to ScORC6. By alignment, it was found that the N-terminal of CfORC6 has about 30% identities with other ORC6s, but about 100aa of C-terminal of CfORC6 has no identity with other ORC6s. Like ScORC6, CfORC6 has many potential phosphorylation sites, (S/T)PXK. Like DmORC6, CfORC6 has leucine-rich region in the relevant site. Northern Blot showed that CfORC6 mRNA is about 2,000nt. Southern Blot confirmed that there is one copy of CfORC6 gene in spruce budworm genome. Western blot showed that infection of Cf124T cells with CfMNPV didnot affect the expression levels of CfORC6, at least up to 26 hr post infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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