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TP53 mutations andMDM2 gene amplification in squamous-cell carcinomas of the esophagus in South Thailand

2000· article· en· W2022106386 sur OpenAlexaff
Philippe Tanière, Ghyslaine Martel‐Planche, Puttisak Puttawibul, Alan G. Casson, Ruggero Montesano, A Chanvitan, Pierre Hainaut

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationEsophagusIncidence (geometry)BiologyGeneGeneticsMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Squamous-cell carcinoma of the esophagus (SCCE) shows geographic variations in incidence that are thought to reflect the etiological involvement of environmental or dietary risk factors. Mutations of TP53 are frequent in SCCE, and there is evidence that both the frequency and type of these mutations may differ from one geographic area to the other. Although SCCE is relatively rare in most parts of Thailand, the province of Songkhla (south Thailand) has been described as a high-risk area for SCCE. We have analyzed 56 SCCE cases from this area for TP53 mutations by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE, exons 5-8) and direct DNA sequencing. The same tumors were also analyzed for MDM2 gene amplification by differential PCR. TP53 mutations were detected in 23 cases (41%). In contrast, clear amplification of MDM2 was detected in only 2 cases (4%), both of which contained wild-type TP53. Comparison with published results from other geographic areas of high SCCE incidence revealed that the spectrum of TP53 mutations in south Thailand is similar to that observed in central China (Henan Province) but clearly differs from that of SCCE from western Europe (Normandy, France; northern Italy), with more G:T transversions and fewer mutations affecting A and T base pairs. These results suggest that SCCE from south Thailand and from central China may involve similar risk factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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