MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2022116685 · doi:10.1021/jm100679e

Integration of Lead Optimization with Crystallography for a Membrane-Bound Ion Channel Target: Discovery of a New Class of AMPA Receptor Positive Allosteric Modulators

2010· article· en· W2022116685 sur OpenAlexaff
Simon E. Ward, Mark H Harries, Laura Aldegheri, Nigel Austin, Stuart P. Ballantine, Elisa Ballini, Daniel M. Bradley, B.D. Bax, Brian Clarke, A. I. Harris, Stephen A. Harrison, Rosemary A. Melarange, Claudette Mookherjee, J. Mosley, Gianni Dal Negro, Beatrice Oliosi, Kathrine J. Smith, Kevin M. Thewlis, P.M. Woollard, Shahnaz P. Yusaf

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesEli Lilly and Company
Mots-clésChemistryAllosteric regulationAMPA receptorIon channelLigand efficiencyDrug discoverySmall moleculeAllosteric modulatorLigand (biochemistry)Lead compoundTolerabilityCombinatorial chemistryStereochemistryComputational biologyBiophysicsReceptorBiochemistryPharmacologyGlutamate receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel series of AMPAR positive modulators is described that were identified by high throughput screening. The molecules of the series have been optimized from a high quality starting point hit to afford excellent developability, tolerability, and efficacy profiles, leading to identification of a clinical candidate. Unusually for an ion channel target, this optimization was integrated with regular generation of ligand-bound crystal structures and uncovered a novel chemotype with a unique and highly conserved mode of interaction via a trifluoromethyl group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,145
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Medicinal ChemistryMême sujetReceptor Mechanisms and SignalingTravaux en français237 207