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Enregistrement W2022131093 · doi:10.1186/s13059-015-0619-z

Deleterious effects of endocrine disruptors are corrected in the mammalian germline by epigenome reprogramming

2015· article· en· W2022131093 sur OpenAlexfundno aff
Khursheed Iqbal, Diana A. Tran, Arthur X. Li, Charles Warden, Angela Y. Bai, Purnima Singh, Xiwei Wu, Gerd P. Pfeifer, Piroska E. Szabó

Notice bibliographique

RevueGenome Biology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesInstitute of GeneticsNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyReprogrammingEpigenomeEpigeneticsGermlineDNA methylationGenomic imprintingGeneticsSomatic cellGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Exposure to environmental endocrine-disrupting chemicals during pregnancy reportedly causes transgenerationally inherited reproductive defects. We hypothesized that to affect the grandchild, endocrine-disrupting chemicals must alter the epigenome of the germ cells of the in utero-exposed G1 male fetus. Additionally, to affect the great-grandchild, the aberration must persist in the germ cells of the unexposed G2 grandchild. RESULTS: Here, we treat gestating female mice with vinclozolin, bisphenol A, or di-(2-ethylhexyl)phthalate during the time when global de novo DNA methylation and imprint establishment occurs in the germ cells of the G1 male fetus. We map genome-wide features in purified G1 and G2 prospermatogonia, in order to detect immediate and persistent epigenetic aberrations, respectively. We detect changes in transcription and methylation in the G1 germline immediately after endocrine-disrupting chemicals exposure, but changes do not persist into the G2 germline. Additional analysis of genomic imprints shows no persistent aberrations in DNA methylation at the differentially methylated regions of imprinted genes between the G1 and G2 prospermatogonia, or in the allele-specific transcription of imprinted genes between the G2 and G3 soma. CONCLUSIONS: Our results suggest that endocrine-disrupting chemicals exert direct epigenetic effects in exposed fetal germ cells, which are corrected by reprogramming events in the next generation. Avoiding transgenerational inheritance of environmentally-caused epigenetic aberrations may have played an evolutionary role in the development of dual waves of global epigenome reprogramming in mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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