Proteomic profiling of two maize inbreds during early gibberella ear rot infection
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Fusarium graminearum is the causal agent of gibberella ear rot in maize ears, resulting in yield losses due to mouldy and mycotoxin-contaminated grain. This study represents a global proteomic approach to document the early infection by F. graminearum of two maize inbreds, B73 and CO441, which differ in disease susceptibility. Mock- and F. graminearum-treated developing kernels were sampled 48 h post-inoculation over three field seasons. Infected B73 kernels consistently contained higher concentrations of the mycotoxin deoxynivalenol than the kernels of the more tolerant inbred CO441. A total of 2067 maize proteins were identified in the iTRAQ analysis of extracted kernel proteins at a 99% confidence level. A subset of 878 proteins was identified in at least two biological replicates and exhibited statistically significantly altered expression between treatments and/or the two inbred lines of which 96 proteins exhibited changes in abundance >1.5-fold in at least one of the treatments. Many proteins associated with the defense response were more abundant after infection, including PR-10 (PR, pathogenesis-related), chitinases, xylanase inhibitors, proteinase inhibitors, and a class III peroxidase. Kernels of the tolerant inbred CO441 contained higher levels of these defense-related proteins than B73 kernels even after mock treatment, suggesting that these proteins may provide a basal defense against Fusarium infection in CO441.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle