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Enregistrement W2022455714 · doi:10.1046/j.1440-1835.2002.00280.x

Using molecular data to resolve the taxonomic limits of the genera Callophyllis, Euthora and Pugetia (Kallymeniaceae, Rhodophyta)

2002· article· en· W2022455714 sur OpenAlexaff
James Harper, Gary W. Saunders

Notice bibliographique

RevuePhycological Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolyphylyBiologySensuMonophylyGenusZoologyType speciesPhylogenetic treeTaxonomy (biology)BotanyClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SUMMARY Callophyllis is the largest genus in the red algal family Kallymeniaceae and includes over 50 described species. Since its description, there has been considerable debate over the circumscription of this genus relative to related genera. Specifically, the genus Euthora has sometimes been placed in synonymy with Callophyllis, and a number of species of Pugetia have been transferred to Callophyllis. Phylogenetic analyses based on sequences of nuclear large-subunit ribosomal DNA for representatives of the Kallymeniaceae were completed to assess the various taxonomic proposals surrounding Callophyllis, Euthora and Pugetia. Results indicate that the genus Callophyllis (as generally recognized) is polyphyletic. Callophyllis cristata occupies a position in the trees separate from the remainder of Callophyllis species (including the type Callophyllis variegata), supporting recognition of Euthora as a distinct genus. Callophyllis chilensis and Callophyllis firma group with the type species of Pugetia, Pugetia fragilissima, thus confirming an earlier taxonomic decision to include these species in the latter genus. A discussion of the relative merits of various reproductive versus vegetative features for assigning species among these three genera is provided. Though outside the scope of the current study, relationships among species of Callophyllis sensu stricto must be visited in light of the results. Although the remaining six species of Callophyllis included in the present trees unequivocally form a monophyletic group, two isolates identified as Callophyllis pinnata (from California and Chile) do not group together, illustrating the confusion generated from the morphological variation within this genus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,589
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,503
Tête enseignante GPT0,382
Écart entre enseignants0,121 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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