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Enregistrement W2022497376 · doi:10.1002/path.4090

The autophagy protein <scp>LC3A</scp> correlates with hypoxia and is a prognostic marker of patient survival in clear cell ovarian cancer

2012· article· en· W2022497376 sur OpenAlexafffund
Jaeline E. Spowart, Katelin N. Townsend, Hassan Huwait, Sima Eshragh, Nathaniel R. West, Jenna Ries, Steve E. Kalloger, Michael S. Anglesio, Sharon M. Gorski, Peter H. Watson, C. Blake Gilks, David G. Huntsman, Julian J. Lum

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaVancouver General HospitalUniversity of VictoriaBC Cancer AgencySimon Fraser UniversityCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAutophagySerous fluidOvarian cancerHypoxia (environmental)BiologyCancer researchClear cellProgrammed cell deathTumor hypoxiaCellInternal medicineCancerOncologyPathologyImmunohistochemistryApoptosisMedicineImmunologyRadiation therapyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clear cell ovarian cancer histotypes exhibit metabolic features associated with resistance to hypoxia and glucose deprivation-induced cell death. This metabolic characteristic suggests that clear cell ovarian cancers activate survival mechanisms not typical of other epithelial ovarian cancers. Here we demonstrate that microtubule-associated protein 1 light chain 3A (LC3A), a marker of autophagy, is related to hypoxia and poor prognosis in clear cell ovarian cancer. In 485 ovarian tumours, we found that LC3A was significantly associated with poor progression-free (p = 0.0232), disease-specific (p = 0.0011) and overall patient survival (p = 0.0013) in clear cell ovarian cancer patients, but not in other subtypes examined. LC3A was an independent prognostic marker of reduced disease-specific [hazard ratio (HR): 2.55 (95% CI 1.21-5.37); p = 0.014] and overall survival [HR: 1.95 (95% CI 1.00-3.77); p = 0.049] in patients with clear cell ovarian carcinoma. We also found a strong link between autophagy and hypoxia as LC3A staining revealed a significant positive association with the hypoxia-related proteins carbonic anhydrase-IX and HIF-1α. The functional link between hypoxia and autophagy was demonstrated using clear cell and high-grade serous cell lines that were subjected to hypoxia or hypoxia + glucose deprivation. Clear cell carcinoma lines displayed greater autophagy induction and were subsequently more sensitive to inhibition of autophagy under hypoxia compared to the high-grade serous lines. Together, our findings indicate that hypoxia-induced autophagy may be crucial to the clinical pathology of clear cell ovarian cancer and is a potential explanation for histological subtype differences in patient disease progression and outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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