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Enregistrement W2022527135 · doi:10.1371/journal.pone.0073623

All That Glitters Isn't Gold: A Survey on Acknowledgment of Limitations in Biomedical Studies

2013· article· en· W2022527135 sur OpenAlexaff
Gerben ter Riet, Paula Chesley, Alan G. Gross, Lara Siebeling, Patrick Muggensturm, Nadine Heller, Martin Umbehr, Daniela Vollenweider, Tsung Yu, Elie A. Akl, Lizzy M. Brewster, Olaf M. Dekkers, Ingrid Mühlhauser, Bernd Richter, Sonal Singh, Steven N. Goodman, Milo A. Puhan

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmaceutical industry and healthcare
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineUniversity of Minnesota
Mots-clésWeightingGuidelineConfoundingMEDLINEPsychologyActuarial scienceComputer scienceData scienceMedicinePolitical scienceEconomicsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Acknowledgment of all serious limitations to research evidence is important for patient care and scientific progress. Formal research on how biomedical authors acknowledge limitations is scarce. OBJECTIVES: To assess the extent to which limitations are acknowledged in biomedical publications explicitly, and implicitly by investigating the use of phrases that express uncertainty, so-called hedges; to assess the association between industry support and the extent of hedging. DESIGN: We analyzed reporting of limitations and use of hedges in 300 biomedical publications published in 30 high and medium -ranked journals in 2007. Hedges were assessed using linguistic software that assigned weights between 1 and 5 to each expression of uncertainty. RESULTS: Twenty-seven percent of publications (81/300) did not mention any limitations, while 73% acknowledged a median of 3 (range 1-8) limitations. Five percent mentioned a limitation in the abstract. After controlling for confounders, publications on industry-supported studies used significantly fewer hedges than publications not so supported (p = 0.028). LIMITATIONS: Detection and classification of limitations was--to some extent--subjective. The weighting scheme used by the hedging detection software has subjective elements. CONCLUSIONS: Reporting of limitations in biomedical publications is probably very incomplete. Transparent reporting of limitations may protect clinicians and guideline committees against overly confident beliefs and decisions and support scientific progress through better design, conduct or analysis of new studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,256
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,581
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,744
Score d'incertitude au seuil0,918

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2560,581
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0120,010
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0060,010
Science ouverte0,0020,007
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,859
Tête enseignante GPT0,558
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomainePrésentation des résultats
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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