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Enregistrement W2022602119 · doi:10.1210/me.2015-1119

Editorial: What's in a Name, or the Impact of Misnomers in Endocrine Research

2015· editorial· en· W2022602119 sur OpenAlexafffund
Vincent Giguère

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2015
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiomedical Text Mining and Ontologies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésMisnomerObject (grammar)DiseaseMisattribution of memoryEpistemologyPsychologyBiologyMedicinePsychiatryComputer sciencePathologyCognitionPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The simplest definition of the word “misnomer” is that of a wrong name or inappropriate designation for a person, a place, or an object. Alternatively, in the case that interests us in this editorial, it can be a gene or its gene product. In everyday life, the use of misnomers, such as referring to a small meteorite entering the earth atmosphere as a “shooting star,” often has no practical consequence. In fact, misnomers such as this example can add a dose of poetry in our lives, allowing us to dream of distant universes for a brief moment. However, in medicine, the use of misnomers to identify a symptom or a disease can have more serious consequences, such as misdiagnosis or incorrect treatments, even by welltrained physicians. A quick search of PubMed yields a long list of such occurrences that includes, for example, the misnomer “lupus anticoagulant,” a coagulation inhibitor originally identified in patients with systemic lupus erythematosus, but its presence is actually associated with thromboembolic events that may strike in otherwise healthy individuals (1). In medical research, the consequences of using misnomers might be less dire but, nonetheless, can lead some misguided investigators to pursue research projects in the wrong direction, misinterpret the results of their investigations, alter the conclusion of their work, and at worst, perpetuate false concepts and deceptive hypotheses. Although the routine use of misnomers is more often an annoyance than a critical threat to medical research, this phenomenon can stunt progress and further demonstrates a certain lack of rigor in the scientific process. In the biological sciences, misnomers can originate from the fact that a gene/protein has two or more possible functions, but that the name in use reflects a minor or even a physiologically irrelevant function of the gene/protein rather than its true role(s). Misnomers also arise because the entity named received its designation based on the first alleged function assigned to it, long before its true function was recognized. A paradigm for these occurrences is the superfamily of nuclear receptors, in which misnomers are widespread. The problems for this group of genes are further compounded in that many nuclear receptors were codiscovered by different groups, each using a different name for the same receptor. In 1999, researchers in the field agreed to a new nomenclature to unambiguously identify each nuclear receptor (2). The nomenclature was based on subfamilies and groups of receptors as part of a phylogenetic tree that connects all known nuclear receptor sequences, and each receptor was assigned an alphanumeric name analogous to a “postal code.” It was recommended that the receptor(s) be identified by the official name(s) at least once in a manuscript, preferably in the abstract and/or the introduction. Once the receptor was matched to its “official name or code,” authors were then encouraged to use the trivial name for the remainder of the manuscript. More on that subject later. Although the use of this nomenclature restored some order in this dysfunctional family, not all authors com-

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Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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