P-Loop Residues Critical for Selectivity in K+ Channels Fail to Confer Selectivity to Rabbit HCN4 Channels
Notice bibliographique
Résumé
HCN channels are thought to be structurally similar to Kv channels, but show much lower selectivity for K+. The approximately 3.3 A selectivity filter of K+ channels is formed by the pore-lining sequence XT(V/I)GYG, with X usually T, and is held stable by key residues in the P-loop. Differences in the P-loop sequence of HCN channels (eg. the pore-lining sequence L478C479IGYG) suggest these residues could account for differences in selectivity between these channel families. Despite being expressed, L478T/C479T HCN4 channels did not produce current. Since threonine in the second position is highly conserved in K+ channels, we also studied C479T channels. Based on permeability ratios (PX/PK), C479T HCN4 channels (K+(1)>Rb+(0.85)>Cs+(0.59)>Li+(0.50)>or=Na+(0.49)) were less selective than WT rabbit HCN4 (K+(1)>Rb+(0.48)>Cs+(0.31)>or=Na+(0.29)>Li+(0.03)), indicating that the TIGYG sequence is insufficient to confer K+ selectivity to HCN channels. C479T HCN4 channels had an increased permeability to large organic cations than WT HCN4 channels, as well as increased unitary K+ conductance, and altered channel gating. Collectively, these results suggest that HCN4 channels have larger pores than K+ channels and replacement of the cysteine at position 479 with threonine further increases pore size. Furthermore, selected mutations in other regions linked previously to pore stability in K+ channels (ie. S475D, S475E and F471W/K472W) were also unable to confer K+ selectivity to C479T HCN4 channels. Our findings establish the presence of the TIGYG pore-lining sequence does not confer K+ selectivity to rabbit HCN4 channels, and suggests that differences in selectivity of HCN4 versus K+ channels originate from differences outside the P-loop region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».