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Enregistrement W2022677544 · doi:10.1002/jcb.20508

Role of <i>O</i>‐linked β‐<i>N</i>‐acetylglucosamine modification in the subcellular distribution of alpha4 phosphoprotein and Sp1 in rat lymphoma cells

2005· article· en· W2022677544 sur OpenAlexaff
Shauna Dauphinee, Marlene Ma, Catherine K.L. Too

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphoproteinCytosolChemistrySubcellular localizationNuclear transportPhosphorylationNuclear export signalCell nucleusSmall interfering RNAMolecular biologyCell biologyTransfectionBiochemistryEnzymeCytoplasmBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mTOR alpha4 phosphoprotein is a prolactin (PRL)‐downregulated gene product that is found in the nucleus of PRL‐dependent rat Nb2 lymphoma cells. Alpha4 lacks a nuclear localization signal (NLS) and the mechanism of its nuclear targeting is unknown. Post‐translational modification by O‐linked β‐N‐acetylglucosamine (O‐GlcNAc) moieties has been implicated in the nuclear transport of some proteins, including transcription factor Sp1. The nucleocytoplasmic enzymes O‐β‐N‐acetylglucosaminyltransferase (OGT) and O‐β‐N‐acetylglucosaminidase (O‐GlcNAcase) adds or remove O‐GlcNAc moieties, respectively. If O‐GlcNac moieties contribute to the nuclear targeting of alpha4, a decrease in O‐GlcNAcylation (e.g., by inhibition of OGT) may redistribute alpha4 to the cytosol. The present study showed that alpha4 and Sp1 were both O‐GlcNAcylated in quiescent and PRL‐treated Nb2 cells. PRL alone or PRL + streptozotocin (STZ; an O‐GlcNAcase inhibitor) significantly (P ≤ 0.05) increased the O‐GlcNAc/alpha4 ratio above that in control quiescent cells. However, PRL + alloxan (ALX; an OGT inhibitor) or ALX alone did not decrease O‐GlcNAcylation of alpha4 below that of controls and alpha4 remained nuclear. In comparison, PRL (±ALX/STZ) greatly increased Sp1 protein levels, caused a significant decrease in the GlcNAc/Sp1 ratio (P ≤ 0.05, n = 3) as compared to controls and partially redistributed Sp1 to the cytosol. Finally, a 50% downregulation of OGT gene expression by small interfering RNA (i.e., siOGT) partially redistributed both alpha4 and Sp1 to the cytosol. The alpha4 protein partner PP2Ac had no detectable O‐GlcNAc moieties and its nuclear distribution was not affected by siOGT. In summary, alpha4 and Sp1 contained O‐GlcNAc moieties, which contributed to their nuclear targeting in Nb2 cells. © 2005 Wiley‐Liss, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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