The Position of Arginine 124 Controls the Rate of Iron Release from the N-lobe of Human Serum Transferrin
Notice bibliographique
Résumé
Human serum transferrin (hTF) is a bilobal iron-binding and transport protein that carries iron in the blood stream for delivery to cells by a pH-dependent mechanism. Two iron atoms are held tightly in two deep clefts by coordination to four amino acid residues in each cleft (two tyrosines, a histidine, and an aspartic acid) and two oxygen atoms from the "synergistic" carbonate anion. Other residues in the binding pocket, not directly coordinated to iron, also play critical roles in iron uptake and release through hydrogen bonding to the liganding residues. The original crystal structures of the iron-loaded N-lobe of hTF (pH 5.75 and 6.2) revealed that the synergistic carbonate is stabilized by interaction with Arg-124 and that both the arginine and the carbonate adopt two conformations (MacGillivray, R. T. A., Moore, S. A., Chen, J., Anderson, B. F., Baker, H., Luo, Y. G., Bewley, M., Smith, C. A., Murphy, M. E., Wang, Y., Mason, A. B., Woodworth, R. C., Brayer, G. D., and Baker, E. N. (1998) Biochemistry 37, 7919-7928). In the present study, we show that the two conformations are also found for a structure at pH 7.7, indicating that this finding was not strictly a function of pH. We also provide structures for two single point mutants (Y45E and L66W) designed to force Arg-124 to adopt each of the previously observed conformations. The structures of each mutant show that this goal was accomplished, and functional studies confirm the hypothesis that access to the synergistic anion dictates the rate of iron release. These studies highlight the importance of the arginine/carbonate movement in the mechanism of iron release in the N-lobe of hTF. Access to the carbonate via a water channel allows entry of protons and anions, enabling the attack on the iron.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».