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Enregistrement W2022732151 · doi:10.1046/j.1439-0329.2003.00343.x

Genetic transformation, electrophoretic karyotyping and isolation of insertional mutants in the tree pathogenic fungus <i>Neonectria galligena</i>

2003· article· en· W2022732151 sur OpenAlexafffund
Philippe Tanguay, J. Coupal, Louis Bernier

Notice bibliographique

RevueForest Pathology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEli Lilly and Company
Mots-clésBiologyHygromycin BProtoplastMutantTransformation (genetics)PlasmidSouthern blotMolecular biologyAgarose gel electrophoresisMyceliumgenomic DNAMicrobiologyGeneBiochemistryBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary The ascomycete tree pathogen Neonectria galligena was transformed using several plasmid vectors containing the bacterial hygromycin phosphotransferase gene ( hph ) conferring resistance to hygromycin B. Protoplasts were produced by digesting germinating conidia in a Novozym 234 solution osmotically stabilized with NaCl. The protoplasts regenerated at ca. 70% on complete medium supplemented with either sucrose or NaCl. Up to 115 hygromycin B‐resistant transformants per microgram of transforming DNA per 10 8 protoplasts were obtained. Southern analysis of genomic DNA from the transformants, separated by either standard agarose gel electrophoresis or by pulsed field gel electrophoresis, confirmed that hygromycin B resistance resulted from integration of the vector. Transformants expressing the green fluorescent protein were also obtained. A total of 209 transformants were then screened for aggressiveness and mycelial radial growth. Four mutants were identified including one mutant with reduced aggressiveness but normal growth in vitro , two mutants with reduced growth in vitro but normal aggressiveness, and one mutant in which both aggressiveness and in vitro growth were reduced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,898
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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