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Visualization of synaptic markers in the optic neuropils ofDrosophila using a new constrained deconvolution method

2000· article· en· W2022916469 sur OpenAlexafffund
P. Robin Hiesinger, Michael Scholz, Ian A. Meinertzhagen, Karl‐Friedrich Fischbach, Klaus Obermayer

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Comparative Neurology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthBundesministerium für Bildung und ForschungKillam TrustsBoehringer Ingelheim Fonds
Mots-clésDeconvolutionColocalizationBiologySynaptic vesicleConfocal microscopyMicroscopyConfocalDrosophila melanogasterImmunoelectron microscopyBiological systemCell biologyNeuroscienceOpticsPhysicsVesicleGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fruitfly Drosophila melanogaster offers compelling genetic advantages for the analysis of its nervous system, but cell size precludes immunocytochemical analysis of wild-type structure and mutant phenotypes beyond the level of neuronal arborizations. For many antibodies, especially when immunoelectron microscopy is not feasible, it would therefore be desirable to extend the resolution limit of confocal microscopy as far as possible. Because high-resolution confocal microscopy suffers from considerable blurring, so-called deconvolution algorithms are needed to remove, at least partially, the blur introduced by the microscope and by the specimen itself. Here, we present the establishment and application of a new deconvolution method to visualize synaptic markers in Drosophila optic neuropils at the resolution limit of light. We ascertained all necessary parameters experimentally and verified them by deconvolving injected fluorescent microspheres in immunostained optic lobe tissue. The resulting deconvolution method was used to analyze colocalization between the synaptic vesicle marker neuronal synaptobrevin and synaptic and putative synaptic markers in photoreceptor terminals. We report differential localization of these near the resolution limit of light, which could not be distinguished without deconvolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,518
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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