MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2022931518 · doi:10.1107/s0108767305091518

Molecular basis for Tay-Sachs revealed by the crystal structure of human β-hexosaminidaseA

2005· article· en· W2022931518 sur OpenAlexaff
M.J. Lemieux, Brian L. Mark, M.M. Cherney, Stefan Knapp, D. L. Mahuran, M.N.G. James

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids FoundationUniversity of ManitobaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBasis (linear algebra)Computational biologyEvolutionary biologyBiologyGeneticsCrystallographyChemistryMathematicsGeometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

environmental contaminants. Here we present the crystal structure of the terminal oxygenase component of the biphenyl dioxygenase (BphA1A2) derived from Rhodococcus strain sp. RHA1. This is the first crystal structure of the biphenyl dioxygenase. We also determined the crystal structure of the BphA1A2-biphenyl complex. Structural comparison between the substrate free and complex forms revealed that the substrate-binding pocket makes significant conformational changes upon substrate binding to accommodate the substrate into the pocket. The analysis with the two crystal structures suggested that the residues in the substrate-binding pocket can be classified into three groups, which respectively seem to be responsible for the catalytic reaction, the orientation/conformation of the substrate, and the conformational changes of the substrate-binding pocket.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,898
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Crystallographica Section A Foundations of CrystallographyMême sujetLysosomal Storage Disorders ResearchTravaux en français237 207