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Enregistrement W2022970838 · doi:10.7448/ias.17.4.19518

The R263K mutation in HIV integrase that is selected by dolutegravir may actually prevent clinically relevant resistance to this compound

2014· article· en· W2022970838 sur OpenAlexaff
Mark A. Wainberg, Kaitlin Anstett, Thibault Mésplède, Peter K. Quashie, Ying-Shan Han, Maureen Oliveira

Notice bibliographique

RevueJournal of the International AIDS Society · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDolutegravirIntegraseRaltegravirIntegrase inhibitorVirologyMutationMutagenesisResistance mutationDrug resistanceViral replicationBiologyMedicineGeneticsVirusViral loadHuman immunodeficiency virus (HIV)Reverse transcriptaseGeneAntiretroviral therapyPolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Drug resistance against dolutegravir (DTG) or the nucleosides with which it has been co-administered has never been observed in patients receiving this drug in first-line therapy. In contrast, a R263K mutation that confers low-level resistance (3-4 fold) to DTG has been selected by DTG in culture. Our group has ascribed the absence of resistance to DTG to the high fitness cost exacted by the R263K mutation and an inability of HIV to generate compensatory mutations. MATERIALS AND METHODS: We generated recombinant integrase enzymes and viruses containing various combinations of mutations and studied these enzymatically and in culture. We also selected for resistance against raltegravir (RAL) using viruses containing the R263K mutation. RESULTS: The R263K mutation alone conferred an approximate 3-fold level of resistance to DTG and a 40% loss in viral replicative capacity and recombinant integrase activity. Secondary mutations selected at positions H51Y or E138K did not individually affect either enzyme activity or DTG resistance, but the combination of R263K together with H51Y or E138K increased DTG resistance to about 7-fold accompanied by a ≈75% loss in each of viral replication capacity, and both in vitro and in vivo integrase activity. Conversely, combinations of R263K together with multiple resistance mutations for RAL and/or EVG at positions 92,143, 148 and 155 resulted in even further diminished enzymatic activity that may be incompatible with viral survival. Modelling of the 3-dimensional structure of integrase suggests that R263K is located in a region that may not permit further mutagenesis if secondary mutations at H51Y or E138K are also present. Moreover, integrase that contains R263K together with substitutions at positions 92, 143, 148 and 155 may be enzymatically inactive. The use of the R263K-containing virus to select for resistance to RAL led to the appearance of RAL-containing mutations but the loss of R263K. CONCLUSIONS: Secondary mutations to R263K following selection with DTG have all led to diminished viral and enzymatic fitness, helping to explain why resistance to DTG in previously drug-naïve subjects has never been observed. The use of DTG in first-line therapy may prevent the facile development of drug resistance and help to forestall ongoing HIV transmission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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