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Enregistrement W2022990208 · doi:10.1089/zeb.2006.3.347

Conservation of Synteny Between Guppy and <i>Xiphophorus</i> Genomes

2006· article· en· W2022990208 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueZebrafish · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Behavior and Reproduction
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXiphophorusGuppyBiologyGeneticsEvolutionary biologyMicrosatelliteGeneAlleleFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The guppy and fish in the genus Xiphophorus have both been important model systems for the study of natural and sexual selection for over 50 years. Whereas the guppy is unique in the degree to which the environmental variables shaping phenotypic variation are known, Xiphophorus has the advantage that genomic resources have been developed due to the utility of this taxon for the study of melanoma. If linkage maps for the guppy and Xiphophorus are similar, genomic resources developed in Xiphophorus will be useful in the guppy. The authors used an F2 mapping cross of divergent populations of the guppy to construct partial female and male genetic linkage maps incorporating microsatellite markers derived from Xiphophorus mapping efforts. Flanking regions for a sample of microsatellites occurring in maps for both taxa were sequenced in the guppy and compared to published sequences from Xiphophorus. This confirmed that these loci were homologous and estimated the divergence in neutral nuclear DNA to be 0.21 substitutions per site. The female map comprises 16 linked markers on six linkage groups, and the male map comprises 24 markers on nine linkage groups. Linkage relationships among loci homologous in the guppy and Xiphophorus primarily show conservation of genetic architecture between species, but several major changes were detected.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,371
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle