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Enregistrement W2023139178 · doi:10.1021/pr4010184

Quantitative Glycoproteomics Analysis Reveals Changes in N-Glycosylation Level Associated with Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

2014· article· en· W2023139178 sur OpenAlex
Sheng Pan, Ru Chen, Yasuko Tamura, David A. Crispin, Lisa A. Lai, Damon May, Martin McIntosh, David R. Goodlett, Teresa A. Brentnall

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthUniversity of UtahUniversity of TorontoUniversity of Washington
Mots-clésGlycosylationPancreatic cancerGlycoproteomicsPancreasCancer researchBiologyGlycoproteinCA19-9CarcinogenesisCancerEndocrinologyBiochemistryGlycanGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycosylation plays an important role in epithelial cancers, including pancreatic ductal adenocarcinoma. However, little is known about the glycoproteome of the human pancreas or its alterations associated with pancreatic tumorigenesis. Using quantitative glycoproteomics approach, we investigated protein N-glycosylation in pancreatic tumor tissue in comparison with normal pancreas and chronic pancreatitis tissue. The study lead to the discovery of a roster of glycoproteins with aberrant N-glycosylation level associated with pancreatic cancer, including mucin-5AC (MUC5AC), carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 (CEACAM5), insulin-like growth factor binding protein (IGFBP3), and galectin-3-binding protein (LGALS3BP). Pathway analysis of cancer-associated aberrant glycoproteins revealed an emerging phenomenon that increased activity of N-glycosylation was implicated in several pancreatic cancer pathways, including TGF-β, TNF, NF-kappa-B, and TFEB-related lysosomal changes. In addition, the study provided evidence that specific N-glycosylation sites within certain individual proteins can have significantly altered glycosylation occupancy in pancreatic cancer, reflecting the complexity of the molecular mechanisms underlying cancer-associated glycosylation events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,633
Score d'incertitude au seuil0,635

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle