Insights into the mechanism of function of a protein unfolding and degradation system
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
ClpP is a cylindrical tetradecameric serine protease whose activity is regulated by the unfoldase ATP-dependent chaperones ClpX and ClpA of the AAA+ superfamily. The chaperones act to select substrate proteins, unfold them, and then thread them into the ClpP cylinder for degradation. ClpP can only degrade small peptides on its own. Structural and functional studies from my group have elucidated the mechanism of function of the ClpXP chaperone-protease system. These studies highlighted the importance of protein dynamics in this system. More recently, we used ClpP as a target in a high-throughput screen for compounds, which activate the protease and allow it to degrade larger proteins, hence, abolishing the specificity arising from the ATP-dependent chaperones. Our screen resulted in five structurally distinct compounds, which we designate as activators of self-compartmentalizing proteases 1 to 5 (ACP 1 to 5). The compounds are found to stabilize the ClpP double ring structure. The ACP1 chemical structure was considered to have drug-like characteristics and was further optimized to give analogs with bactericidal activity. Hence, the ACPs represent new classes of compounds that can activate ClpP and that can be developed as potential novel antibiotics.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle