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Enregistrement W2023284187 · doi:10.1371/journal.pone.0043494

Cleavage of Nidogen-1 by Cathepsin S Impairs Its Binding to Basement Membrane Partners

2012· article· en· W2023284187 sur OpenAlexaff
Juliette Sage, Emmanuelle Leblanc‐Noblesse, Carine Nizard, Takako Sasaki, Sylvianne Schnebert, Éric Perrier, Robin Kurfürst, Dieter Brömme, Gilles Lalmanach, Fabien Lecaille

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInstitut National de la Recherche AgronomiqueCentre National de la Recherche ScientifiqueAssociation Nationale de la Recherche et de la TechnologieInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésProteasesCATSCathepsinProteolysisChemistryCleavage (geology)Cathepsin SCathepsin LBasement membraneCell biologyBiochemistryMolecular biologyBiologyEnzymeMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cathepsin S (catS), which is expressed in normal human keratinocytes and localized close to the dermal-epidermal junction (DEJ) degrades some of major basement membrane (BM) constituents. Among them, catS readily hydrolyzed in a time and dose dependent manner human nidogen-1 (nid-1) and nidogen-2, which are key proteins in the BM structure. CatS preferentially cleaved nid-1 at both acid and neutral pH. Hydrolysis of nid-1 was hampered in murine ctss(-/-) spleen lysates pretreated with inhibitors of other classes of proteases. Nid-1 was cleaved within its G2 and G3 globular domains that are both involved in interactions with other BM components. Binding assays with soluble and immobilized ligands indicated that catS altered the formation of complexes between nid-1 and other BM components. Assuming that the cleavage of nid-1 impairs its ability to crosslink with BM partners and perturbs the viscoelastic properties of BM matrix, these data indicate that catS may participate in BM proteolysis, in addition to already identified proteases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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