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Enregistrement W2023357032 · doi:10.1016/j.febslet.2006.05.003

Functional dissection of human protease μ‐calpain in cell migration using RNAi

2006· article· en· W2023357032 sur OpenAlexaff
Meiqun Wu, Zhenbao Yu, Jinjiang Fan, Antoine W. Caron, Malcolm Whiteway, Shi‐Hsiang Shen

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensMcGill UniversityBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalpainGene knockdownRNA interferenceProteasesCell biologyCysteine proteaseFilaminProteolysisGene isoformCell migrationBiologyProteaseChemistryCellRNABiochemistryGeneEnzymeCytoskeleton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calpains are a family of calcium-dependent cysteine proteases involved in a variety of cellular functions. Two isoforms, m-calpain and mu-calpain, have been implicated in cell migration. However, since conventional inhibitors used for the studies of the functions of these enzymes lack specificity, the individual physiological function and biochemical mechanism of these two isoforms, especially mu-calpain, are not clear. In contrast, RNA interference has the potential to allow a sequence-specific destruction of target RNA for functional assay of gene of interest. In the present study, we found that small interfering RNAs-mediated knockdown of mu-calpain expression in MCF-7 cells that do not express m-Calpain led to a reduction of cell migration. This isoform-specific function of mu-calpain was further confirmed by the rescue experiment as overexpression of mu-calpain but not m-calpain could restore the cell migration rate. Knockdown of mu-calpain also altered cell morphology with increased filopodial projections and a highly elongated tail that seemed to prevent cell spreading and migration with reduced rear detachment ability. Furthermore, knockdown of mu-calpain decreased the proteolytic products of filamin and talin, which were specifically rescued by overexpression of mu-calpain but not m-calpain, suggesting that their proteolysis could be one of the key mechanisms by which mu-calpain regulates cell migration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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