A Transmembrane Leucine Zipper Is Required for Activation of the Dimeric Receptor Tyrosine Kinase DDR1
Notice bibliographique
Résumé
Receptor tyrosine kinases of the discoidin domain family, DDR1 and DDR2, are activated by different types of collagen and play important roles in cell adhesion, migration, proliferation, and matrix remodeling. In a previous study, we found that collagen binding by the discoidin domain receptors (DDRs) requires dimerization of their extracellular domains (Leitinger, B. (2003) J. Biol. Chem. 278, 16761-16769), indicating that the paradigm of ligand-induced receptor dimerization may not apply to the DDRs. Using chemical cross-linking and co-immunoprecipitation of differently tagged DDRs, we now show that the DDRs form ligand-independent dimers in the biosynthetic pathway and on the cell surface. We further show that both the extracellular and the cytoplasmic domains are individually dispensable for DDR1 dimerization. The DDR1 transmembrane domain contains two putative dimerization motifs, a leucine zipper and a GXXXG motif. Mutations disrupting the leucine zipper strongly impaired collagen-induced transmembrane signaling, although the mutant DDR1 proteins were still able to dimerize, whereas mutation of the GXXXG motif had no effect. A bacterial reporter assay (named TOXCAT) showed that the DDR1 transmembrane domain has a strong potential for self-association in a biological membrane and that this interaction occurs via the leucine zipper and not the GXXXG motif. Our results demonstrate that the DDRs exist as stable dimers in the absence of ligand and that receptor activation requires specific interactions made by the transmembrane leucine zipper.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».