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Enregistrement W2023529456 · doi:10.1186/1471-2288-14-67

A Bayesian framework for estimating the incremental value of a diagnostic test in the absence of a gold standard

2014· article· en· W2023529456 sur OpenAlexafffund
Daphne I. Ling, Madhukar Pai, Ian Schiller, Nandini Dendukuri

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Research Methodology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGold standard (test)Context (archaeology)Bayesian probabilityBayes' theoremStatisticsSensitivity (control systems)Latent tuberculosisMedicineComputer scienceMathematicsTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The absence of a gold standard, i.e., a diagnostic reference standard having perfect sensitivity and specificity, is a common problem in clinical practice and in diagnostic research studies. There is a need for methods to estimate the incremental value of a new, imperfect test in this context. METHODS: We use a Bayesian approach to estimate the probability of the unknown disease status via a latent class model and extend two commonly-used measures of incremental value based on predictive values [difference in the area under the ROC curve (AUC) and integrated discrimination improvement (IDI)] to the context where no gold standard exists. The methods are illustrated using simulated data and applied to the problem of estimating the incremental value of a novel interferon-gamma release assay (IGRA) over the tuberculin skin test (TST) for latent tuberculosis (TB) screening. We also show how to estimate the incremental value of IGRAs when decisions are based on observed test results rather than predictive values. RESULTS: We showed that the incremental value is greatest when both sensitivity and specificity of the new test are better and that conditional dependence between the tests reduces the incremental value. The incremental value of the IGRA depends on the sensitivity and specificity of the TST, as well as the prevalence of latent TB, and may thus vary in different populations. CONCLUSIONS: Even in the absence of a gold standard, incremental value statistics may be estimated and can aid decisions about the practical value of a new diagnostic test.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,111
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,914
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,832
Score d'incertitude au seuil0,915

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1110,914
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,297
Tête enseignante GPT0,550
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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