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Enregistrement W2023655205 · doi:10.1074/jbc.m001323200

Functional Cloning and Characterization of a Novel Nonhomeodomain Protein That Inhibits the Binding of PBX1-HOX Complexes to DNA

2000· article· en· W2023655205 sur OpenAlexaff
Carolina Abramovich, Weifeng Shen, Nicolas Pineault, Suzan Imren, Ben Montpetit, Corey Largman, R. Keith Humphries

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésHomeoboxBiologyComplementary DNAMolecular biologyHox geneEMX2cDNA libraryNuclear proteinTranscription factorGeneCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PBX1 is a homeodomain protein that functions in complexes with other homeodomain-containing proteins to regulate gene expression during developmental and/or differentiation processes. A yeast two-hybrid screen of a fetal liver-hematopoietic cDNA library using PBX1a as bait led to the discovery of a novel non-homeodomain-containing protein that interacts with PBX1 as well as PBX2 and PBX3. RNA analysis revealed it to be expressed in CD34(+) hematopoietic cell populations enriched in primitive progenitors, as is PBX1; search of the expressed sequence tag data base indicated that it is also expressed in other early embryonic as well as adult tissues. The full-length cDNA encodes a 731-amino acid protein that has no significant homology to known proteins. This protein that we have termed hematopoietic PBX-interacting protein (HPIP) is mainly localized in the cytosol and in small amounts in the nucleus. The region of PBX that interacts with HPIP includes both the homeodomain and immediate N-terminal flanking sequences. Strikingly, electrophoretic mobility shift assays revealed that HPIP inhibits the ability of PBX-HOX heterodimers to bind to target sequences. Moreover, HPIP strongly inhibits the transactivation activity of E2A-PBX. Together these findings suggest that HPIP is a new regulator of PBX function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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