Crystal structure of a benzo[ <i>a</i> ]pyrene diol epoxide adduct in a ternary complex with a DNA polymerase
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The first occupation-associated cancers to be recognized were the sooty warts (cancers of the scrotum) suffered by chimney sweeps in 18th century England. In the 19th century, high incidences of skin cancers were noted among fuel industry workers. By the early 20th century, malignant skin tumors were produced in laboratory animals by repeatedly painting them with coal tar. The culprit in coal tar that induces cancer was finally isolated in 1933 and determined to be benzo[a]pyrene (BP), a polycyclic aromatic hydrocarbon. A residue of fuel and tobacco combustion and frequently ingested by humans, BP is metabolized in mammals to benzo[a]pyrene diol epoxide (BPDE), which forms covalent DNA adducts and induces tumor growth. In the 70 yr since its isolation, BP has been the most studied carcinogen. Yet, there has been no crystal structure of a BPDE DNA adduct. We report here the crystal structure of a BPDE-adenine adduct base-paired with thymine at a template-primer junction and complexed with the lesion-bypass DNA polymerase Dpo4 and an incoming nucleotide. Two conformations of the BPDE, one intercalated between base pairs and another solvent-exposed in the major groove, are observed. The latter conformation, which can be stabilized by organic solvents that reduce the dielectric constant, seems more favorable for DNA replication by Dpo4. These structures also suggest a mechanism by which mutations are generated during replication of DNA containing BPDE adducts.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle