MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2023693885 · doi:10.1021/ac0342976

Detection of G Proteins by Affinity Probe Capillary Electrophoresis Using a Fluorescently Labeled GTP Analogue

2003· article· en· W2023693885 sur OpenAlexfundno aff
Emily E. Jameson, Jennifer M. Cunliffe, Richard R. Neubig, Roger K. Sunahara, Robert T. Kennedy

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of MichiganNational Science Foundation
Mots-clésChemistryCapillary electrophoresisDetection limitChromatographyBODIPYElectrophoresisDissociation constantTrisAnalytical Chemistry (journal)Gel electrophoresisFluorescenceBradford protein assayBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An affinity probe capillary electrophoresis (APCE) assay for guanine-nucleotide-binding proteins (G proteins) was developed using BODIPY FL GTPgammaS (BGTPgammaS), a fluorescently labeled GTP analogue, as the affinity probe. In the assay, BGTPgammaS was incubated with samples containing G proteins and the resulting mixtures of BGTPgammaS-G protein complexes and free BGTPgammaS were separated by capillary electrophoresis and detected with laser-induced fluorescence detection. Separations were completed in less than 30 s using 25 mM Tris, 192 mM glycine at pH 8.5 as the electrophoresis buffer and applying 555 V/cm over a 4-cm separation distance. BGTPgammaS-Galpha(o) peak heights increased linearly with Galpha(o) up to approximately 200 nM using a 50 nM BGTPgammaS probe. The detection limit for Galpha(o) was 2 nM, corresponding to a mass detection limit of 3 amol. The high speed of the APCE assays allowed reaction kinetics and the dissociation constant (Kd) to be determined. The on-rate and off-rate of BGTPgammaS to Galpha(o) were 0.0068 +/- 0.0004 and 0.000 23 +/- 0.000 01 s(-1), respectively. The half-life of the BGTPgammaS-Galpha(o) complex was 3060 +/- 240 s and Kd was 8.6 +/- 0.7 nM. The estimates of these parameters are in good agreement with those obtained using established techniques, indicating the suitability of this method for such measurements. Lowering the temperature of the separation improved the detection of the complex, allowing the assay to be performed on a commercial instrument with longer separation times. Additionally, the capability of the technique to detect several G proteins based on their binding to BGTPgammaS was demonstrated with assays for Galpha and Galpha(i1) and for Ras and Rab3A.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,824

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnalytical ChemistryMême sujetAdvanced biosensing and bioanalysis techniquesTravaux en français237 207