Kinetic properties of chimeric class I aldehyde dehydrogenases for retinal isomers
Notice bibliographique
Résumé
Retinal dehydrogenase type 1 (RALDH1) catalyzes the oxidation of all-trans and 9-cis retinal to the respective retinoic acids (RAs), whereas another member of the aldehyde dehydrogenase (ALDH) family, the phenobarbital-induced aldehyde dehydrogenase (PB-ALDH), is very poorly active. We have previously generated chimeras between these 2 enzymes that displayed selectivity for retinal isomers in crude bacterial extracts. Here we have characterized the kinetic properties of the corresponding purified recombinant proteins. The all-trans selective chimera RALDH-131 converted all-trans retinal to all-trans RA with 2.9-fold lower efficiency than the wild-type RALDH1 and had only residual activity with 9-cis retinal. The converse chimera PB-131 was specific for 9-cis retinal, with no residual activity for all-trans retinal. MgCl2 inhibited the activities of RALDH1 and PB-131, but not of RALDH-131, suggesting that amino acids 132-510 in RALDH are necessary for inhibition by MgCl2. These data demonstrate that the chimeric enzymes act as retinal isomer-selective ALDHs, and suggest that these enzymes may be useful to study the roles of cis RA isomers in embryogenesis and differentiation in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».