The Caspase-1 Digestome Identifies the Glycolysis Pathway as a Target during Infection and Septic Shock
Notice bibliographique
Résumé
Caspase-1 is an essential effector of inflammation, pyroptosis, and septic shock. Few caspase-1 substrates have been identified to date, and these substrates do not account for its wide range of actions. To understand the function of caspase-1, we initiated the systematic identification of its cellular substrates. Using the diagonal gel proteomic approach, we identified 41 proteins that are directly cleaved by caspase-1. Among these were chaperones, cytoskeletal and translation machinery proteins, and proteins involved in immunity. A series of unexpected proteins along the glycolysis pathway were also identified, including aldolase, triose-phosphate isomerase, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, alpha-enolase, and pyruvate kinase. With the exception of the latter, the identified glycolysis enzymes were specifically cleaved in vitro by recombinant caspase-1, but not caspase-3. The enzymatic activity of wild-type glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, but not a non-cleavable mutant, was dampened by caspase-1 processing. In vivo, stimuli that fully activated caspase-1, including Salmonella typhimurium infection and septic shock, caused a pronounced processing of these proteins in the macrophage and diaphragm muscle, respectively. Notably, these stimuli inhibited glycolysis in wild-type cells compared with caspase-1-deficient cells. The systematic characterization of caspase-1 substrates identifies the glycolysis pathway as a caspase-1 target and provides new insights into its function during pyroptosis and septic shock.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».