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Enregistrement W2023789857 · doi:10.1074/jbc.m008646200

Interaction of the N- and C-terminal Domains of Vinculin

2001· article· en· W2023789857 sur OpenAlexaff
Gregory J. Miller, Stanley D. Dunn, Eric H. Ball

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNatural product bioactivities and synthesis
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTerminal (telecommunication)VinculinCell biologyComputer scienceBiologyTelecommunicationsFocal adhesionSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vinculin head to tail intramolecular self-association controls its binding sites for other components of focal adhesions. To study this interaction, the head and tail domains were expressed, purified, and assayed for various characteristics of complex formation. Analytical centrifugation demonstrated a strong interaction in solution and formation of a complex more asymmetric than either of the individual domains. A survey of binding conditions using a solid-phase binding assay revealed characteristics of both electrostatic and hydrophobic forces involved in the binding. In addition, circular dichroism of the individual domains and the complex demonstrated that conformational changes likely occur in both domains during association. The interaction sites were more closely mapped on the protein sequence by deletion mutagenesis. Amino acids 181-226, a basic region within the acidic head domain, were identified as a binding site for the vinculin tail, and residues 1009-1066 were identified as sufficient for binding the head. Moreover, mutation of an acidic patch in the tail (residues 1013-1015) almost completely eliminated its ability to interact with the head domain further supporting the significance of ionic interactions in the binding. Our data indicate that the interaction between the head and tail domains of vinculin occurs through oppositely charged contact sites and results in conformational changes in both domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,152

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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