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Enregistrement W2023796415 · doi:10.1039/c4mb00097h

Comparing systemic metabolic responses in mice to single or dual infection with <i>Plasmodium berghei</i> and <i>Heligmosomoides bakeri</i>

2014· article· en· W2023796415 sur OpenAlexaff
Lucienne Tritten, Jennifer Keiser, Tasneem Karwa, Jürg Utzinger, Elaine Holmes, Jasmina Saric

Notice bibliographique

RevueMolecular BioSystems · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensMcGill UniversitySte. Anne's Hospital
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésPlasmodium bergheiBiologyPhenotypeMalariaParasite hostingVirologyImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Concomitant infections with Plasmodium and gastrointestinal nematodes are frequently observed in humans. At the metabolic level, the cross-talk between the host and multiple coexisting pathogens is poorly characterized. The purpose of this study was to give a comprehensive insight into the systemic metabolic phenotype of mice with a single or dual infection with Plasmodium berghei and Heligmosomoides bakeri. Four groups of eight NMRI female mice were infected with P. berghei or H. bakeri, or with both species concurrently. An additional group remained uninfected, and served as control. Mice were sacrificed at day 19 of the experiment. We collected samples from the liver, spleen, kidney, three intestinal regions, and four brain regions. All biological samples were subjected to (1)H nuclear magnetic resonance spectroscopy, combined with multivariate data analysis, to establish metabolic fingerprints of each tissue from the various infection groups. Compared to uninfected mice, single and dual species infection models showed unique metabolic profiles. P. berghei exerted major effects on glycolysis, tricarboxylic acid cycle, and nucleotide and amino acid metabolism in all studied tissues with the exception of the gut. H. bakeri was characterized by a dysregulation of choline and lipid metabolism in most tissues examined with a particularly strong imprint in the jejunum. Simultaneous co-infection with P. berghei and H. bakeri induced the strongest and most diverse effects in the liver and spleen but led to only minor changes in the intestinal and cerebral parts assessed. Infection with P. berghei showed more pronounced and systemic alterations in the mice metabolic profile than H. bakeri infection. The metabolic fingerprints in the co-infection models were driven by P. berghei infection, whilst the presence of H. bakeri in co-infections had little effect. However, simultaneous co-infection showed indeed the least metabolic disruptions in the peripheral tissues, namely the gut and brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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