Genetic diversity of Canadian elite summer rape (<i>Brassica napus</i> L.) cultivars from the pre- to post-canola quality era
Notice bibliographique
Résumé
The development of canola quality Brassica napus oilseed cultivars was a major achievement of Canadian public oilseed breeding programs. Simple sequence repeat (SSR) markers were applied to assess the genetic diversity of 300 plants representing one landrace introduced from Argentina in 1943, seven Canadian elite cultivars developed and released by Agriculture and Agri-Food Canada since 1954, and two European cultivars that were the source of the low erucic acid and low glucosinolate traits that define canola quality. Application of 22 SSR primer pairs from eight linkage groups detected 88 polymorphic alleles from 33 likely loci. The allelic frequencies in 300 samples ranged from 0.003 to 0.993 and averaged 0.388. The estimates of mean heterozygosity for these cultivars ranged from 0.055 to 0.203 and averaged 0.139. The most SSR variation was detected in the cultivars Argentine, Golden and Oro. A trend of decline in SSR variation was observed over the years of breeding effort. The proportion of total SSR variation residing among the cultivars was 51.4%; between high vs. low erucic acid cultivars 15% and between high vs. low glucosinolate cultivars 21.2%. Pairwise genetic differentiations among these cultivars ranged from 0.140 to 0.819 and averaged 0.500. Cluster analysis revealed that the genetic relationships of these cultivars were consistent with their known pedigrees. These findings are useful for broadening the genetic base of improved B. napus gene pools, selecting genetically diverse genotypes for hybrid combinations, and conserving summer rape germplasm.Key words: Simple sequence repeat, summer rape, Brassica napus, genetic diversity, genetic relationship, genetic structure
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».