MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2023916538 · doi:10.1016/j.jalz.2013.03.001

Operationalizing protocol differences for EADC‐ADNI manual hippocampal segmentation

2013· article· en· W2023916538 sur OpenAlexafffund
Marina Boccardi, Martina Bocchetta, Rossana Ganzola, Nicolas Robitaille, Alberto Redolfi, Simon Duchesne, Clifford R. Jack, Giovanni B. Frisoni, George Bartzokis, John G. Csernansky, Mony J. de Leon, Leyla deToledo‐Morrell, Ronald Killiany, Stéphane Lehéricy, Nikolai Malykhin, Johannes Pantel, Jens C. Pruessner, Hilkka Soininen, Craig Watson

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institute on AgingNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchAvid RadiopharmaceuticalsNational Institutes of HealthInnogeneticsTakeda Pharmaceutical CompanyUniversity of PittsburghPfizerBioClinicaBayer HealthCareGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsServierWyethAbbott FundBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyAstraZenecaNovartis Pharmaceuticals CorporationMedpaceGenentechBiogen IdecSynarcRocheEisaiAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerck
Mots-clésSubiculumSegmentationAtrophyLandmarkMagnetic resonance imagingHippocampal formationArtificial intelligenceHippocampusPsychologyNeuroscienceComputer scienceMedicinePathologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hippocampal volumetry on magnetic resonance imaging is recognized as an Alzheimer's disease (AD) biomarker, and manual segmentation is the gold standard for measurement. However, a standard procedure is lacking. We operationalize and quantitate landmark differences to help a Delphi panel converge on a set of landmarks. METHODS: One hundred percent of anatomic landmark variability across 12 different protocols for manual segmentation was reduced into four segmentation units (the minimum hippocampus, the alveus/fimbria, the tail, and the subiculum), which were segmented on magnetic resonance images by expert raters to estimate reliability and AD-related atrophy. RESULTS: Intra- and interrater reliability were more than 0.96 and 0.92, respectively, except for the alveus/fimbria, which were 0.86 and 0.77, respectively. Of all AD-related atrophy, the minimum hippocampus contributed to 67%; tail, 24%; alveus/fimbria, 4%; and the subiculum, 5%. CONCLUSIONS: Anatomic landmark variability in available protocols can be reduced to four discrete and measurable segmentation units. Their quantitative assessment will help a Delphi panel to define a set of landmarks for a harmonized protocol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,311
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,397
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,311
Score d'incertitude au seuil0,849

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3110,397
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & DementiaMême sujetDementia and Cognitive Impairment ResearchTravaux en français237 207