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Enregistrement W2023968457 · doi:10.1021/bi901615v

Steroidogenic Acute Regulatory Protein Has a More Open Conformation Than the Independently Folded Smaller Subdomains

2009· article· en· W2023968457 sur OpenAlexaff
Himangshu S. Bose, Randy M. Whittal, Dilip Kumar Debnath, Mahuya Bose

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSteroid Chemistry and Biochemistry
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development
Mots-clésChemistryProtein structureComputational biologyBiophysicsBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The acute steroidogenic response, which produces steroids in response to stress, requires the steroidogenic acute regulatory protein (StAR). StAR, a mitochondrial matrix protein, acts on the outer mitochondrial membrane (OMM) to facilitate the movement of cholesterol from the outer to inner mitochondrial membrane via an unknown mechanism. The N-terminal sequence was reported to be nonessential for activity. We show that alteration of the StAR amino-terminal sequence does not change the thermodynamic stability of StAR but offers protection from proteolytic degradation. A longer association between StAR and the OMM strengthens the interaction with cholesterol. Far-UV CD spectra showed that the smaller fragments of StAR domains were less alpha-helical compared to N-62 StAR but were structured as determined by limited proteolysis followed by mass spectrometry. The START domain consisting of amino acids 63-193 also exhibited protease protection for amino acids 84-193. The Stern-Volmer quenching constant (K(SV)) of the N-62 StAR protein is 12.1 x 10(5) M(-1), with all other START fragments having significantly smaller K(SV) values ranging from 6 to 10 x 10(5) M(-1), showing that N-62 StAR has a more open conformation. Only N-62 StAR protein is stabilized with cholesterol having an increased DeltaH value of -5.6 +/- 0.3 kcal/mol at 37 degrees C. These findings demonstrate a mechanism in which StAR is stabilized at the OMM by cholesterol to initiate its massive import into mitochondria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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