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Enregistrement W2023979443 · doi:10.1002/bip.20188

Reversible assembly of helical filaments by de novo designed minimalist peptides

2004· article· en· W2023979443 sur OpenAlex
David Frost, Christopher M. Yip, Avijit Chakrabartty

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSupramolecular Self-Assembly in Materials
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPeptideBiophysicsCircular dichroismCrystallographyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have designed a series of 15 short, helical de novo peptides consisting of lysine, isoleucine, and alanine. We have termed this the KIA series. These peptides differ only in their hydrophobic interface, and thus their self-association is largely a consequence of hydrophobic interactions. One of these peptides, KIA13, forms insoluble helical fibers at specific NaCl concentrations. We have used CD spectroscopy, turbidity assays, and in situ tapping mode atomic force microscopy to characterize the reversible assembly pathway for this peptide. It is unfolded at low NaCl concentration, and forms helical, soluble fibers resembling a coiled-coil conformation at intermediate NaCl concentrations, and rope-like insoluble fibers at high NaCl concentrations. Reducing the NaCl concentration completely reverses this process. Another peptide from the KIA series specifically inhibits the formation of the insoluble KIA13 fibers, and reverses the process to some extent. This work sheds light onto protein fibrillogenesis and offers intriguing possibilities for the use of these types of peptides in drug delivery and biomaterials applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle