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Enregistrement W2023990263 · doi:10.1042/bj20020593

Role of Cys41 in the N-terminal domain of lumican in ex vivo collagen fibrillogenesis by cultured corneal stromal cells

2003· article· en· W2023990263 sur OpenAlexaff
Eric C. Carlson, Kazuhisa Mamiya, Chia‐Yang Liu, Robert L. Gendron, David E. Birk, James L. Funderburgh, Winston W.‐Y. Kao

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Eye Institute
Mots-clésLumicanFibrillogenesisMolecular biologyProteoglycanCell cultureChemistryExtracellular matrixCell biologyStromal cellBiologyBiochemistryFibrilDecorin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The keratan sulphate proteoglycan lumican regulates collagen fibrillogenesis to maintain the integrity and function of connective tissues such as cornea. We examined the role of a highly conserved cysteine-containing domain proximal to the N-terminus of lumican in collagen fibrillogenesis using site-specific mutagenesis to prepare plasmid DNA encoding wild-type murine lumican (Cys(37)-Xaa(3)-Cys(41)-Xaa-Cys-Xaa(9)-Cys) and a Cys-->Ser (C/S) mutant (Cys(37)-Xaa(3)-Ser(41)-Xaa-Cys-Xaa(9)-Cys). cDNAs were cloned into the pSecTag2A vector, and cultures of MK/T-1 cells (an immortalized cell line from mouse keratocytes) were transfected with the cDNAs. Stable transformants were selected and cloned in the presence of Zeocin. All stable transformants maintained a dendritic morphology and growth rate similar to those of parental MK/T-1 cells. Western blot analysis with anti-lumican antibody detected a 42 kDa lumican protein secreted into the culture medium of both wild-type and C/S mutant lumican cell lines. Ultrastructural analyses by transmission electron microscopy showed both cell lines to form a multi-layered stroma ex vivo, but the matrix assembled by the two cell lines differed. Compared with the mutant cell line, the wild-type cells assembled a more organized matrix with regions containing orthogonal collagen fibrils. In addition, the fibrils in the extracellular matrix formed by the mutant cell line exhibited alterations in fibril packing and structure. Immunostaining analysed by confocal microscopy showed a further difference in this matrix, with the marked occurrence of lumican and collagen I co-localization in the lumican wild-type cells, but a lack thereof in the lumican C/S mutant cells. The results indicate that the cysteine-rich domain of lumican is important in collagen fibrillogenesis and stromal matrix assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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