Three-dimensional Structure of Wza, the Protein Required for Translocation of Group 1 Capsular Polysaccharide across the Outer Membrane of Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
Wza is a highly conserved multimeric outer membrane protein complex required for the surface expression of the serotype K30 group 1 capsular polysaccharide in Escherichia coli. Here we present the first three-dimensional structure of this type of polysaccharide exporter at a 15.5-A resolution obtained using single particle averaging on a dataset of cryo-negatively stained protein. Previous structural studies on purified Wza have revealed a homo-oligomeric ring structure that is most probably composed of eight subunits. Symmetry analysis of the three-dimensional structure combined with biochemical two- and three-dimensional crystallographic data strongly suggest that Wza is an octameric complex with a C4 quasi-rotational symmetry and is organized as a tetramer of dimeric subunits. Wza is best described as a stack of two 4-A high rings with differing diameters providing a mushroom-like aspect from the side. The larger ring has a distinctive square shape with a diameter of 115 A, whereas the smaller is almost circular with a diameter of 90 A. In the center of the complex and enclosed by the four symmetrical arms is a small elliptical cagelike cavity of approximately 40 A in diameter. The central cavity is effectively sealed at the top and bottom of the complex but has small inter-arm holes when viewed from the side. We discuss the structure of this complex and implications in the surface translocation of cell-surface polysaccharide.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».