Tandem mass spectrometric determination of purine metabolites and adenosine deaminase activity for newborn screening of ADA–SCID
Notice bibliographique
Résumé
Background: Screening newborns for severe combined immunodeficiency (SCID) aims for early identification and treatment of the affected newborns. Adenosine deaminase (ADA) deficiency, a defect in the purine metabolic pathway, is a major cause of SCID and is characterized by the accumulation of adenosine (Ado) and deoxyadenosine (dAdo) in dried blood spots (DBSs). If left untreated, infants with this disorder are at risk of life-threatening infections. Analysis of T-cell receptor excision circles (TRECs) in DBS samples is the gold-standard screening method. However, TREC analysis is insufficient to determine SCID etiology, and a fraction of ADA–SCID may not be detected. Methods: We used the original DBS screening sample to measure Ado, dAdo, and ADA activity. Erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl) adenine was used as an ADA inhibitor to imitate ADA deficiency, making it possible to create quality control material with pathological enzyme activity and metabolite levels. Quantification was achieved by tandem mass spectrometric analysis with a run time of 2.5 min. Results: The 95th percentile reference intervals (n = 588) of Ado and dAdo were 0.9–3.0 and 0.1–0.4 µmol/L, respectively. The 95th percentile reference interval (n = 200) of ADA activity using13C10,15N5Ado and15N5dAdo as substrates were 0.8–1.6 and 0.4–0.7 pmol/DBS, respectively. In confirmed ADA patients (n = 4), Ado and dAdo were significantly elevated, whereas ADA activity was almost absent. Conclusion: These novel methods are applied, in our lab, to samples with low TRECs, with no false negative or false positives encountered to date. The potential of using these methods as a primary screening approach for ADA–SCID is in the process of validation. Statement of novelty: New mass spectrometric methods to simultaneously measure adenosine, deoxyadenosine, guanosine, and deoxguanosine, as well as ADA activity in neonatal DBS samples have been developed. This methodology highlights the metabolic nature of ADA–SCID and complements TREC analysis by providing additional biochemical information.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».