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Enregistrement W2024290101 · doi:10.1094/pdis-93-7-0765c

First Report of Grape Root Rot Caused by <i>Roesleria subterranea</i> in Michigan

2009· article· en· W2024290101 sur OpenAlexaboutno aff
Timothy D. Miles, A. M. C. Schilder

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPotato dextrose agarHorticultureConidiumBotanySporeInoculationFibrous root systemVineInternal transcribed spacerRoot rotFungusAgarPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In September of 2008, declining grapevines were observed in two vineyards (Vitis interspecific hybrids 'Canada Muscat' and 'Chardonel') in Fennville, MI. Affected vines were stunted with shortened internodes and yellow leaves; others had dead cordons or were entirely dead. The grower reported that vines were losing vigor and collapsing during a period of 2 years. Renewal trunks would collapse during the second season of growth. Several symptomatic vines showed signs of root decay. On one vine, distinctive fruiting bodies (mazaedia) were apparent on the roots below the soil line and resembled those of Roesleria subterranea (Weinm.) Redhead (2,3,4). The mazaedia were 4 to 5 mm tall and 1 mm in diameter with white-to-tan stipes and powdery, gray-to-greenish hemispherical heads. Ascospores were hyaline to light grayish green, disk shaped, and 4 to 6 μm in diameter. This fungus, also known as R. hypogaea Thüm & Pass., has been previously reported to cause grape root rot, vine decline, and replant problems in North America and Europe (2,3,4). The fungus was cultured from ascospores on potato dextrose agar (PDA). Colonies grew slowly (approximately 2 mm per day at 22 to 24°C) and were green in the center. No spores were produced. DNA was extracted, and internal transcribed spacer (ITS) sequences obtained by PCR were compared with known sequences using BLASTn (1). Our isolate had 100% ITS sequence homology to an isolate from Germany, Roesleria subterranea strain IB (Accession No. EF060304.1). To test for pathogenicity, the fungus was grown in potato dextrose broth for 14 days at 22 to 24°C. An aqueous suspension (0.1 g of fungus per ml) was prepared by blending mycelia with sterile deionized water (SDW) in a food processor. Five two-node, rooted 'Chardonnay' cuttings (45 days old) were placed in the suspension. Five other cuttings were placed in SDW (control). After 3 h, plants were removed and repotted in fresh BACTO soil (Michigan Peat Company, Houston, TX) and kept in a growth chamber at 23°C with a 16/8-h light/dark cycle. After 25 days, inoculated plants were, on average, 63% smaller with 77% lower fresh-root weight and fewer fine roots than the control plants. The pathogen was recovered from surface-disinfested roots of all five inoculated plants but not from the control plants. Cultures appeared similar to the original isolate and their identity was confirmed by ITS sequencing. To our knowledge, this is the first report of R. subterranea on grapes in Michigan and the Midwest. This fungus needs to be recognized as a potential cause of vine decline and replant problems in Midwestern vineyards. References: (1) S. F. Altschul et al. J. Mol. Biol. 215:403, 1990. (2) W. Gärtel. Page 40 in: Compendium of Grape Diseases. R. C. Pearson and A. C. Goheen, eds. The American Phytopathological Society, St. Paul, MN, 1988. (3) M. Kirchmair et al. Mycol. Res. 112:1210, 2009. (4) J. R. Liberato et al. Pest and Diseases Image Library. Online publication, 2009.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,022

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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