The transport mechanism of the human sodium/<i>myo</i>-inositol transporter 2 (SMIT2/SGLT6), a member of the LeuT structural family
Notice bibliographique
Résumé
The sodium/myo-inositol transporter 2 (SMIT2) is a member of the SLC5A gene family, which is believed to share the five-transmembrane segment inverted repeat of the LeuT structural family. The two-electrode voltage-clamp (TEVC) technique was used to measure the steady-state and the pre-steady-state currents mediated by human SMIT2 after expression in Xenopus laevis oocytes. Phlorizin is first shown to be a poor inhibitor of pre-steady-state currents for depolarizing voltage pulse. From an up to threefold difference between the apparent ON and OFF transferred charges during a voltage pulse, we also show that a fraction of the transient current recorded for very negative potentials is not a true pre-steady-state current coming from the cotransporter conformational changes. We suggest that this transient current comes from a time-dependent leak current that can reach large amplitudes when external Na(+) concentration is reduced. A kinetic model was generated through a simulated annealing algorithm. This algorithm was used to identify the optimal connectivity among 19 different kinetic models and obtain the numerical values of the associated parameters. The proposed 5-state model includes cooperative binding of Na(+) ions, strong apparent asymmetry of the energy barriers, a rate-limiting step that is likely associated with the translocation of the empty transporter, and a turnover rate of 21 s(-1). The proposed model is a proof of concept for a novel approach to kinetic modeling of electrogenic transporters and allows insight into the transport mechanism of members of the LeuT structural family at the millisecond timescale.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».