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Enregistrement W2024462308 · doi:10.1097/mpa.0b013e3180cac723

Protein Expression Profiling Reveals Distinctive Changes in Serum Proteins Associated With Chronic Pancreatitis

2007· article· en· W2024462308 sur OpenAlexaff
Daniel Hartmann, Klaus Felix, Michael R. Ehmann, Martina Schnölzer, Sabine Fiedler, Ralf Bogumil, Markus W. Büchler, Helmut Friess

Notice bibliographique

RevuePancreas · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransthyretinChemistryMass spectrometryBlood proteinsApolipoprotein BPancreatitisTime-of-flight mass spectrometrySurface-enhanced laser desorption/ionizationMatrix-assisted laser desorption/ionizationProteomicsChromatographyMolecular biologyDesorptionInternal medicineBiochemistryBiologyEndocrinologyIonizationIonTandem mass spectrometryMedicineAdsorptionProtein mass spectrometryCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Testing of serum for protein patterns to monitor progression of suspected to definite chronic pancreatitis (CP). METHODS: Serum samples of CP patients and healthy volunteers were fractionated on anion exchange columns and analyzed by surface-enhanced laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry to elucidate CP-related protein alterations and to identify biomarkers for this disease. Potential biomarkers were purified and identified by mass spectrometry. RESULTS: In total, 258 protein peaks were found that discriminated between the 2 groups. Analysis revealed 28 most prominent peaks on immobilized metal affinity capture coupled with Cu and CM10 protein chips, covering the m/z range between 3.3 and 33.3 kd. Performing multivariate pattern analysis, the best pattern model was obtained using fraction 6 on immobilized metal affinity capture coupled with Cu arrays with a sensitivity of 96% and a specificity of 84%. Using a combination of matrix-assisted laser desorption-ionization-time-of-flight mass spectrometry and immunodepletion, we identified 14-m/z peaks. The proteins were found to be significantly decreased in CP serum and were identified as retinol-binding protein, serum amyloid-alpha, apolipoprotein A-II (Apo A-II), Apo C-I, Apo C-II, Apo C-III, and transthyretin and truncated forms thereof. CONCLUSIONS: Distinct protein profile differences exist between normal and CP serum and reflect the metabolic and inflammatory condition in CP patients. The identified protein panel may eventually serve as a diagnostic marker set for CP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,852

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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