Mucolipidosis II: a single causal mutation in the <i>N</i>‐acetylglucosamine‐1‐phosphotransferase gene (<i>GNPTAB</i>) in a French Canadian founder population
Notice bibliographique
Résumé
Mucolipidosis (ML) II (I-cell disease) is a lysosomal storage disorder caused by a deficiency of UDP-N-acetylglucosamine:lysosomal enzyme N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase. MLII is an autosomal recessive disease with a carrier rate estimated at 1/39 in Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ) (Quebec, Canada), which is the highest frequency documented worldwide. To identify the causing mutation, we sequenced GNPTAB exons in 27 parents of 16 MLII-deceased children from the SLSJ region as obligatory and potential carriers. We also performed a genealogical reconstruction for each parent to evaluate consanguinity levels and genetic contribution of ancestors. Our goal was to identify which parameters could explain the high MLII frequency observed in the SLSJ population. A single mutation (c.3503_3504delTC) was found in all obligatory carriers. In addition, 11 apparent polymorphisms were identified. The mutation was not detected in genomic DNA of 50 unrelated controls. Genealogical data show six founders (three couples) with a higher probability of having introduced the mutation in the population. The frequency of the mutation was increased as a consequence of this founder effect and of the resulting population structure. We suggest that c.3503_3504delTC is the allele causing MLII in the SLSJ population, and its high carrier rate is most likely explained by a founder effect.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».