Abstract P5-11-08: SRA/SRAP contributes to TGF-b1 induced cell motility in cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The steroid receptor RNA activator gene (SRA1) is a particularly intriguing genetic system in that both the corresponding RNA (SRA) and protein (SRAP) have been proven to be functional. Accumulated evidence overall suggests that both molecules act as distinct co-regulators of transcription, housed in ribonucleo-protein complexes able to positively or negatively regulate the activity of multiple transcription factors including -but not limited to- several nuclear receptors, MyoD and DAX-1. A role for SRA/SRAP deregulation during breast tumorigenesis has been suggested. Indeed, not only do these molecules regulate the activity of both Estrogen Receptors, these major players in breast cancer etiology, but it has also been shown that SRA RNA is more highly expressed in breast tumors than in normal tissue, and that high levels of SRAP correlated to poorer survival in specific subsets of breast cancer patients. In order to identify the genes and pathways regulated by SRA/SRAP, we performed deep sequencing of transcriptomes from MDA-MB-231 cells depleted of these molecules following RNA interference. The expression of 149 genes was consistently and significantly altered in four independent experiments comparing control RNAi vs SRA RNAi. Interestingly, cluster analysis using Ingenuity software defined a subset of genes (23 out of 149) directly associated with cell movement. Among them figured TGFBR1 (ALK5), a cell surface receptor-kinase mediating TGF-b signalling and a known promoter of cell motility in breast cancer cells. We have now confirmed by quantitative PCR analysis a 40% decrease, upon SRA/SRAP depletion, of TGFBR1 mRNA expression in MDA-MB-231 cells as well as in other breast (MCF7, T5) and non-breast (Hela) cancer cell lines. Consistent with this decrease a drop to 60% of the basal TGFBR1 protein expression is seen by Western blot when MDA-MB-231 cells are depleted of SRA/SRAP. Western blot analyses also revealed that phosphorylation of several SMAD molecules, downstream effectors of TGFBR1 activation by TGF-β1, is impaired in the absence of SRA/SRAP in both MDA-MB-231 and Hela cells. This suggests that SRA/SRAP could potentially regulate TGF beta induced cell motility. Using migration cell assays, we have now confirmed that upon TGF-β1 treatment for 6 hours, SRA/SRAP depleted cells had a significant decrease in migration as compared to control cells. Accordingly, live cell migration assays generated by a time-lapse videomicroscopy system, showed an increased track length and speed in both Hela and 231 cells over-expressed SRAP upon 10 h TGF-β1 treatment. Taken together, these data suggest a cross-talk between SRA/SRAP and TGF-β signalling and induced cell motility. Citation Information: Cancer Res 2013;73(24 Suppl): Abstract nr P5-11-08.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».