MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2024640621 · doi:10.1021/jf0721242

Flexible Microarray Construction and Fast DNA Hybridization Conducted on a Microfluidic Chip for Greenhouse Plant Fungal Pathogen Detection

2007· article· en· W2024640621 sur OpenAlexaff
Lin Wang, Paul C. H. Li

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural and Food Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Capillary Electrophoresis Applications
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBotrytis cinereaOligonucleotideMicrofluidicsDNA microarrayBiologyHybridization probeChipBotrytisDNADNA–DNA hybridizationMolecular biologyHorticultureMaterials scienceNanotechnologyGeneticsGeneComputer scienceGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study employed a microfluidic method in which probe creation does not require pin-spotting and fast hybridization is conducted on the same microarray chip for the detection of three greenhouse pathogens ( Botrytis cinerea, Didymella bryoniae, and Botrytis squamosa). In this method, 16 oligonucleotide probe line arrays were created on a glass substrate by a microfluidic printing method. Then, low amounts of the DNA samples (1 fmol of oligonucelotides or 1.4 ng of PCR products) were introduced into the microchannels that were orthogonal to these probe lines. The hybridizations of 16 samples (21-mer complementary oligonuleotides and approximately 260 bp PCR products) were fulfilled at the channel-probe line intersections and in a short time (minutes). The optimization of probe immobilization and sample hybridization are described in detail. The method successfully detected and discriminated between two 260 bp PCR products with a one-base-pair difference from closely related greenhouse plant fungal pathogens (B. cinerea and B. squamosa).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,410

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Agricultural and Food ChemistryMême sujetMicrofluidic and Capillary Electrophoresis ApplicationsTravaux en français237 207