Abstract A25: PPP2R1A mutations affect PP2A complex formation, and novel protein interactions in gynecological carcinoma cell lines
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Gynecological malignancies (ovarian clear cell and endometrioid carcinomas, endometrial serous, endometrioid and clear cell carcinomas) harbor somatic mutations in the gene PPP2R1A, the scaffolding subunit of the serine/threonine protein phosphatase 2A (PP2A) complex. The PP2A complex is composed of an A (scaffold), C (catalytic) subunit, and different B (regulatory) subunits. The PPP2R1A mutations are proposed to play a role in PP2A B-subunit binding, and thus formation of a functional PP2A phosphatase complex. The aim of this study is to determine how PPP2R1A mutations affect the binding of B-subunits and other novel interactions within the context of ovarian and endometrial carcinomas. The ovarian clear cell line RMG2 and endometrial carcinoma cell lines Hec-1-A and Hec50 all harbor PPP2R1A mutations. The mismatch repair deficient cell line Hec-1-A express a PPP2R1A W257L heterozygous mutation; therefore somatic cell knockout technology was used to generate isogenic PPP2R1A clones that express only mutant PPP2R1A, and clones that express more wild-type than mutant. These Hec-1-A isogenic cell lines were used for PPP2R1A co-immunoprecipiation (Co-IP) followed by MS/MS-SWATHTM analysis to identify PP2A B-subunits and other novel protein interactions. Our preliminary results using Hec-1-A isogenic cell lines suggest that some PP2A B-subunits (PPP2R5D and PPP2R2A) are found to be decreased in abundance in the mutant cell lines. We were able to identify the catalytic subunit (PPP2CA) in PPP2R1A Co-IPs in all cell lines. We also show that PPP2R1A interacts with novel proteins such as histones (Histone 1, Histone H2B type 1-N), ubiquitin ligases (TRIM21) and proteins involved in mitotic control (ANKLE2). Of particular interest we have identified the cancer gene nucleophosmin (NPM1) as a potential novel interactor of PP2A. We have established the isogenic Hec-1-A cell lines as a model system to determine the functional effects of a somatic PPP2R1A mutation. These cell lines have shown that the PPP2R1A mutation affects the ability of some B-subunits to interact and form the PP2A complex. We have also shown that PP2A may interact with novel proteins such as NPM1 and histones. Ongoing work will be completed to determine how these interactions function in the context of ovarian and endometrial carcinomas. Citation Format: Melissa K. McConechy, Vincent Chen, Gregg Morin, James Brenton, David G. Huntsman. PPP2R1A mutations affect PP2A complex formation, and novel protein interactions in gynecological carcinoma cell lines. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Advances in Ovarian Cancer Research: From Concept to Clinic; Sep 18-21, 2013; Miami, FL. Philadelphia (PA): AACR; Clin Cancer Res 2013;19(19 Suppl):Abstract nr A25.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».