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Enregistrement W2024714939 · doi:10.1021/bi002819v

Asymmetric Structure of the Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Chloride Channel Pore Suggested by Mutagenesis of the Twelfth Transmembrane Region

2001· article· en· W2024714939 sur OpenAlexaff
Jyoti Gupta, Alexandra Evagelidis, John W. Hanrahan, Paul Linsdell

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcGill UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorChloride channelTransmembrane proteinMutagenesisRegulatorConductanceChemistryChlorideBiophysicsTransmembrane domainMembraneBiochemistryBiologyMutationPhysicsGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) Cl(-) channel contains 12 membrane-spanning regions which are presumed to form the transmembrane pore. Although a number of findings have suggested that the sixth transmembrane region plays a key role in forming the pore and determining its functional properties, the role of other transmembrane regions is currently not well established. Here we assess the functional importance of the twelfth transmembrane region, which occupies a homologous position in the carboxy terminal half of the CFTR molecule to that of the sixth transmembrane region in the amino terminal half. Five residues in potentially important regions of the twelfth transmembrane region were mutated individually to alanines, and the function of the mutant channels was examined using patch clamp recording following expression in mammalian cell lines. Three of the five mutations significantly weakened block of unitary Cl(-) currents by SCN(-), implying a partial disruption of anion binding within the pore. Two of these mutations also caused a large reduction in the steady-state channel mean open probability, suggesting a role for the twelfth transmembrane region in channel gating. However, in direct contrast to analogous mutations in the sixth transmembrane region, all mutants studied here had negligible effects on the anion selectivity and unitary Cl(-) conductance of the channel. The relatively minor effects of these five mutations on channel permeation properties suggests that, despite their symmetrical positions within the CFTR protein, the sixth and twelfth transmembrane regions make highly asymmetric contributions to the functional properties of the pore.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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