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Enregistrement W2024754727 · doi:10.1139/o05-147

Pathways for compartmentalizing protein synthesis in eukaryotic cells: the template-partitioning model

2005· review· en· W2024754727 sur OpenAlexvenueno aff
Christopher V. Nicchitta, Rachel S. Lerner, Samuel B. Stephens, Rebecca D. Dodd, Brook Pyhtila

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2005
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésRibosomeSignal recognition particleRNATranslation (biology)Endoplasmic reticulumCell biologyCytosolBiologyProtein biosynthesisMessenger RNASignal peptideProtein targetingBiochemistryGenePeptide sequenceEnzymeMembrane protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

mRNAs encoding signal sequences are translated on endoplasmic reticulum (ER) -- bound ribosomes, whereas mRNAs encoding cytosolic proteins are translated on cytosolic ribosomes. The partitioning of mRNAs to the ER occurs by positive selection; cytosolic ribosomes engaged in the translation of signal-sequence-bearing proteins are engaged by the signal-recognition particle (SRP) pathway and subsequently trafficked to the ER. Studies have demonstrated that, in addition to the SRP pathway, mRNAs encoding cytosolic proteins can also be partitioned to the ER, suggesting that RNA partitioning in the eukaryotic cell is a complex process requiring the activity of multiple RNA-partitioning pathways. In this review, key findings on this topic are discussed, and the template-partitioning model, describing a hypothetical mechanism for RNA partitioning in the eukaryotic cell, is proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,402
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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