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Enregistrement W2024760098 · doi:10.1158/1538-7445.pedcan-b43

Abstract B43: Role of activated SHP2 in high-risk neuroblastoma pathogenesis

2014· article· en· W2024760098 sur OpenAlexaff
Shizhen Zhu, Benjamin G. Neel, A. Thomas Look

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroblastomaZebrafishCancer researchBiologyPediatric cancerGanglioneuromaCarcinogenesisOncogeneTransgeneGenetically modified mouseN-MycPenetranceCancerGeneGeneticsPhenotypeCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neuroblastoma, an embryonic tumor of peripheral sympathetic nervous system (PSNS), accounts for 10% of all childhood cancer deaths. We recently developed a robust zebrafish model of neuroblastoma and demonstrated that activated ALK synergizes with MYCN by inhibiting a developmentally-timed apoptotic response that is otherwise induced by MYCN. Genomic studies show that PTPN11 (encoding SHP2) is the second most frequently mutated genes in high-risk neuroblastoma. We have now used our zebrafish model to ask whether mutationally activated SHP2 functions as an oncogene in neuroblastoma. We developed transgenic lines in which ptpn11E69K is overexpressed in the PSNS under control of the dopamine-beta-hydroxylase promoter. Interestingly, ptpn11E69Ksynergized with MYCN to accelerate the onset of neuroblastoma in the interrenal gland, the zebrafish analogue of the adrenal medulla. Tumors began to appear at 15 weeks in transgenic fish overexpressing MYCN alone, whereas latency was shortened to 7 weeks and the penetrance was increased more than four-fold in transgenic fish co-expressing MYCN and ptpn11E69K. Co-expression of ptpn11E69K and MYCN also induced ganglioneuroma in the sympathetic ganglia, an outcome that has not been observed in transgenic fish overexpressing MYCN and activated ALK. These results suggest that activated SHP2 can collaborate with MYCN in neuroblastoma tumorigenesis via mechanisms different from those of activated ALK. Thus, zebrafish appears to provide a robust model system for functional genomic analysis and for the investigation of the mechanisms and pathways underlying mutations identified in ongoing tumor resequencing studies. Citation Format: (Jane) shizhen Zhu, Benjamin G. Neel, A. Thomas Look. Role of activated SHP2 in high-risk neuroblastoma pathogenesis. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference on Pediatric Cancer at the Crossroads: Translating Discovery into Improved Outcomes; Nov 3-6, 2013; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;74(20 Suppl):Abstract nr B43.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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